新工具可以快速量化T细胞分数并预测免疫治疗反应

　　伦敦大学学院和伦敦弗朗西斯克里克研究所的科学家们开发了一种新工具，可以快速估计癌症肿瘤中T细胞(免疫细胞)的数量;由于T细胞丰度可以帮助预测患者对免疫治疗的反应，研究人员希望这可以实现更有针对性和更有效的癌症治疗。

　　作为英国癌症研究所资助的TRACERx项目的一部分，科学家们分析了来自患者癌变肿瘤的DNA测序数据，看看他们是否可以量化样本中T细胞的比例。

　　伦敦大学学院癌症研究所的通讯作者Nicholas McGranahan博士解释了这项研究，他说:“DNA测序经常对癌症患者的肿瘤进行分层，以了解癌症是如何发展的。

　　“免疫细胞对控制癌症、影响患者生存和指导治疗很重要，过去仅从DNA测序数据来估计免疫细胞是不可能的。

　　“我们的目标是探索是否可以开发一种新的方法，直接从DNA测序中阐明免疫细胞，而不需要更多的数据。”

　　DNA测序使科学家能够看到单个肿瘤如何发展的进化史。在这项研究中，他们开发了一种工具(或方法)来“回顾”和计算T细胞“VDJ重组”的水平;这是T细胞的一个过程，在这个过程中，它们被重新组装或改变，并被赋予工具，使它们能够识别和攻击入侵者。

　　具体来说，他们发现了一个“信号”，表明T细胞成熟所需的T细胞受体切除环(trec)的缺失，这发生在VDJ重组过程中。通过给这种“损失”打分，他们能够准确地估计肿瘤中存在的T细胞数量。

　　近年来，检查点抑制剂(CPIs)作为一种免疫疗法，已经成为许多癌症类型的革命性治疗方法。

　　cpi通过阻断T细胞产生的检查点蛋白起作用;这些检查点有助于防止免疫反应过于强烈，有时还可以阻止T细胞杀死癌细胞。当这些检查点被阻断时，T细胞可以更好地杀死癌细胞。

　　发现的预测免疫疗法可能成功的生物标志物之一是存在的T细胞数量。供cpi适应的T细胞越多，被摧毁的癌细胞就越多。

　　第一作者、伦敦大学学院癌症研究所高级研究员Robert Bentham博士说:“直接从DNA测序中定量T细胞浸润提供了更大的患者对治疗反应的预测能力，而不需要额外的数据。

　　“事实上，我们开发的过程可以在没有额外时间或成本的情况下完成，超出标准的DNA测序。

　　“我们的工具也将使更多的研究进入免疫系统，而不仅仅是在癌症的背景下。”

　　科学家说，由于该工具目前只在研究中使用，他们需要进一步开发，才能用于临床应用。

　　伦敦大学学院在伦敦弗朗西斯·克里克研究所的研究合作伙伴的协助下进行了这项研究，并使用了由克里克研究所小组组长兼伦敦大学学院克里克肺癌卓越中心主任查尔斯·斯旺顿教授领导的CRUK资助的TRACERx研究中的患者样本。